目前的食品在生產和加工過程中比較普遍地使用農藥、化肥、激素等人工合成化學物質，嚴重地威脅著人類健康。食用安全無污染、高品質的食品已成為眾多消費者的共識和追求，因此有機食品、綠色食品、無公害食品應運而生。
有機食品是指完全不含人工合成的農藥、肥料、生長調節素、催熟劑、家畜禽飼料添加劑的食品。綠色食品是指遵循可持續發展原則，按著特定生產方式，經專門機構認定，許可使用綠色食品標識商標的食品，分A級和AA級。無公害食品是指產地環境、生產過程和終端產品符合無公害食品標準及規范，經過專門機構認定，許可使用無公害食品標識的食品。
有機食品、綠色食品、無公害食品都是安全食品，安全是這三類食品突出的共性，它們從種植、收獲、加工生產、貯藏及運輸過程中都采用了無污染的工藝技術，實行了從土地到餐桌的全程質量控制，保證了食品的安全性。但是，他們又有不同點。
標準不同。就有機食品而言，不同的國家，不同的認證機構，其標準不盡相同。在我國，國家環境保護總局有機食品發展中心制定了有機產品的認證標準。2000年12月美國公布了有機食品全國統一的新標準，日本在2001年4月公布了有機食品法（即JAS法），歐洲國家使用歐盟統一標準EECNO2092／91及其修正案和1804／99有機農業條例。
我國的綠色食品標準是由中國綠色食品發展中心組織指定的統一標準，其標準分為A級和AA級。A級的標準是參照發達國家食品衛生標準和聯合國食品法典委員會（CAC）的標準制定的，AA級的標準是根據I?FOAM有機產品的基本原則，參照有關國家有機食品認證機構的標準，再結合我國的實際情況而制定的。
無公害食品在我國是指產地環境、生產過程和最終產品符合無公害食品的標準和規范。這類產品中允許限量、限品種、限時間的使用人工合成化學農藥、獸藥、魚藥、肥料、飼料添加劑等。
標識不同。有機食品標識在不同國家和不同認證機構是不同的。在我國，國家環境保護總局有機食品發展中心在國家工商局注冊了有機食品標識，中國農業科學院茶葉研究所亦制定了有機茶的標識。2001年國際有機農業運動聯合會（即IFOAM）的成員就擁有有機食品標識380多個。
綠色食品的標識在我國是統一的，也是惟一的，它是由中國綠色食品發展中心制定并在國家工商局注冊的質量認證商標。中國綠色食品的標識由三個部分組成，即上方是太陽，下方是葉片，中心是蓓蕾，正圓形，意為保護。
無公害食品的標識在我國由于認證機構不同而不同，山東、湖南、黑龍江、天津、廣東、江蘇、湖北等省先后分別制定了各自的無公害農產品標識，其中湖北省綠色食品管理辦公室擁有的無公害食品標識已在國家工商局注冊。
級別不同。有機食品無級別之分，有機食品在生產過程中不允許使用任何人工合成的化學物質，而且需要3年的過渡期，過渡期生產的產品為“轉化期”產品。
綠色食品A級和AA級兩個等次。A級綠色食品產地環境質量要求評價項目的綜合污染指數不超過1，在生產加工過程中，允許限量、限品種、限時間的使用安全的人工合成農藥、獸藥、魚藥、肥料、飼料及食品添加劑。AA級綠色食品產地環境質量要求評介項目的單項污染指數不得超過1，生產過程中不得使用任何人工合成的化學物質，且產品需要3年的過渡期。
無公害食品不分級，在生產過程中允許使用限品種、限數量、限時間的安全的人工合成化學物質。
認證機構不同。在我國，有機食品的認證機構有兩家最具權威性。一是國家環境保護總局有機食品發展中心，它是目前國內有機食品綜合認證的權威機構，其次是中國農科院茶葉研究所，該所是目前國內茶葉行業中認證最具權威性。另外亦有一些國外有機食品認證機構在我國發展有機食品的認證工作，如德國的BCS。
綠色食品的認證機構在我國惟一的一家是中國綠色食品發展中心，該中心負責全國綠色食品的統一認證和最終審批。
無公害食品的認證機構較多，目前有許多省、市地區的農業管理主管部門都進行了無公害食品的認證工作，但只有在國家工商局正式注冊標識商標或頒發了省級法規的前提下，其認證才有法律效應。
認證方法不同。在我國，有機食品和AA級綠色食品的認證實行檢查員制度，在認證方法上是以實地檢查認證為主，檢測認證為輔，有機食品的認證重點是農事操作的真實記錄和生產資料購買及應用記錄等。A級綠色食品和無公害食品的認證是以檢查認證和檢測認證并重的原則，同時強調從土地到餐桌的全程質量控制，在環境技術條件的評價方法上，采用了調查評價與檢測認證相結合的方式。
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